Criblage antiviral

Le service de criblage du CEMIPAI est spécialisé dans le test de molécules antivirales. Il est ouvert aux équipes académiques et sociétés privées.

Les expériences sont menées dans les installations de la plateforme par une équipe d’ingénieurs spécialisés dans la manipulation d’agents infectieux de classe 3.

Nos études sont réalisées à façon, avec prise en charge intégrale du projet : réunions préparatoires, réalisation de l’étude, production d’un fichier de données et d’un rapport de résultats

NOTRE VIROTHEQUE

Criblage antiviral

Notre équipe d’ingénieurs possède une vaste expérience dans la découverte d’antiviraux ciblant à la fois les virus et les hôtes, depuis les premières étapes du criblage à moyen débit jusqu’à l’identification et la validation des cibles. Nos tests sont réalisés en microplaques de culture, sur des modèles cellulaires en 2D (monocouches) et 3D (Mucil’Air).  Nos tests sont réalisés sur des échantillons très divers: petites molécules, siRNA, extraits naturels…

Nos services comprennent :

  • Le criblage de petites molécules et de siRNA contre les virus de classe 2 et classe 3 (voir notre virothèque)
  • Des tests à dose unique ou à doses multiples de composés ou de biomolécules dans le système cellulaire choisi, afin de fournir une première indication rapide de l’efficacité contre une gamme de virus ;
  • La détermination de concentrations inhibitrices médianes (EC50), pour définir et évaluer la puissance d’un composé, ou pour comparer l’activité de nouveaux candidats à des molécules connues ;
  • La détermination de la toxicité médiane (TC50) et de l’indice de sélectivité, pour comprendre la cytotoxicité du composé sur une gamme de concentrations et identifier les produits ayant le profil le plus sûr in vitro ;
  • Criblage primaire à moyen/haut débit (jusqu’à une centaine de molécules) et sélection des hits, criblage secondaire et validation des hit
  • Études d’activité combinée, pour identifier les interactions synergiques ou antagonistes de plusieurs composés ;
  • Études de résistance, afin d’évaluer la probabilité d’émergence d’une résistance et de caractériser le type et le nombre de mutations nécessaires à l’échappement viral

Production, Détection de virus et Quantification

Notre virothèque est

Nous proposons une large gamme de tests pour détecter des virus infectieux ou des génomes viraux dans une variété d’échantillons, pour évaluer l’efficacité d’un vaccin ou d’un traitement dans des spécimens animaux ou humains, ainsi que pour aider au développement de nouveaux tests de diagnostic.

Les productions virales sont quantifiées par plages de lyse, RT-qPCR, fluorescence ou luminescence – sur des virus sauvages ou virus rapporteurs exprimant une fluorescence cellulaire.

Nos tests comprennent :

  • Tests de plaque (plaque assay) ou tests immunofocus, pour quantifier les virus formant des plaques ou des foyers ;
  • Tests de mort cellulaire (TCID50) ou des tests basés sur la fluorescence, pour déterminer la concentration de virus nécessaire pour infecter 50 % du type de cellule choisi ;
  • PCR et RT-PCR quantitative en temps réel, pour fournir une mesure relative ou absolue du nombre de copies du génome viral, indépendamment de l’infectivité du virus ;
  • Coloration par immunofluorescence, pour détecter l’infection virale et sa localisation dans le système cellulaire choisi.

Tests d’immunogénicité et d’efficacité d’anticorps

Ce service permet de tester, mesurer et comparer les propriétés neutralisantes d’anticorps ou d’échantillons de sérum

Nos tests comprennent :

  • Tests de micro-neutralisation ou séro-neutralisation pour tester la capacité de dilutions d’anticorps ou de sérums à bloquer l’infection virale;
  • Détermination du titre neutralisant NT50 de sérums ou d’anticorps.

Nathalie Gros

Responsable de service

Ingénieure d’études CNRS

Grégor Dubois

Ingénieur d’études

Floriane Gucciardi

Ingénieure d’études

Selected Publications

  • L. Matignon, N. Gros, R.J-F Kablan, M. Sylvestre, J-D. Marechal, G. Cebrian-Torrejon and L. Brelle. Study of the toxicity and Antiviral Effect of Natural Compounds extracted from Pseudospinx Tetrio and Allamanda Cathartica on Sars-Cov-2 infection. J anal tech Res 2024, (6)2, pp28-35. DOI:10.26502/jatr.42
  • L Cherkashchenko, N. Gros, A. Trausch, A. Neyret, M. Hénaut, et al. Validation of Flavivirus Infectious Clones Carrying Fluorescent Markers for Antiviral Drug Screening and Replication Studies. Front. Microbiol (2023), 14. https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1201640
  • É. Houbron, S. Mockly, S. Rafasse, N. Gros, D. Muriaux & H. Seitz. Biochemistry-informed design selects potent siRNAs against SARS-CoV-2, RNA Biology, 2023, 20:1, 272-280. DOI: 10.1080/15476286.2023.2217400
  • Laplantine, C. Chable–Bessia, A. Oudin, J. Swain, A. Soria, et al.. The FDA–approved drug Auranofin has a dual inhibitory effect on SARS–CoV–2 entry and NF–KB signaling. iScience, 2022, 25 (10), pp.105066. https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.105066
  • Chable–Bessia, C. Boullé, A. Neyret, J. Swain, M. Hénaut, et al.. Low selectivity index of ivermectin and macrocyclic lactones on SARS–CoV2 replication in vitro. COVID 2022, 2(1), 60-75; https://doi.org/10.3390/covid2010005

Tarifs

La tarification auditable est disponible ici